NetAXs autorise la protection d'un fichier isolé, d'un groupe de fichiers ou d'un dossier complet. Différents niveaux de sécurité sont proposés, on peut par exemple laisser un utilisateur lire les fichiers sans qu'il ne puisse les modifier, ou encore interdire la suppression de certains documents. NetAXs gère les documents sensibles, mais aussi les applications, ainsi on autorisera ou non l'utilisation de certains logiciels en fonction de l'utilisateur, un enfant aura par exemple le droit d'accéder aux eux, mais pas aux finances personnelles.